由于电子商务与传统商务活动存在着很大的区别，因此，在对电子商务的安全保障上，与传统商务活动也是截然不同的。由于当今网络的发展本身带来的开放性，网上交易的安全需求则更大。
针对铁路货运电子商务系统本身，它是面向全路的货运客户进行服务的系统，客户有着大量的跨局业务办理的需求，这要求他们在整个分布式系统中具有唯一的身份标识以及安全、可靠的身份鉴别方法，同时对其操作有可追溯性，对关键环节的操作能够防篡改，防抵赖。 在铁路货运电子商务系统中引入数字证书，实现对用户身份认证和电子数据的签名，以确保达到上述安全需求，以《电子签名法》为基础给电子商务过程提供有效的法律依据。
